Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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