Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hoxd13P70217 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd13P70217 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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