Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba4aP68368 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms