Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Lmo4P61969 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Lmo4P61969 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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