Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2kP61087 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2kP61087 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms