Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snap25P60879 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snap25P60879 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms