Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hps5P59438 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hps5P59438 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms