Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
P58686 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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P58686 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P58686 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P58686 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P58686 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
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P58686 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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P58686 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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P58686 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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P58686 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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P58686 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P58686 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P58686 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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