Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samsn1P57725 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms