Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gsc2P56916 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms