Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PctpP53808 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PctpP53808 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PctpP53808 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms