Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpreP49446 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms