Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms