Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdc2P43407 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms