Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms