Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab20P35295 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab20P35295 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab20P35295 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rab20P35295 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab20P35295 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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