Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms