Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp4P35123 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp4P35123 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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