Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Saa4P31532 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Saa4P31532 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms