Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fkbp4P30416 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fkbp4P30416 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms