Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mmp3P28862 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms