Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hoxd10P28359 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hoxd10P28359 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hoxd10P28359 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Hoxd10P28359 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd10P28359 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hoxd10P28359 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxd10P28359 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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