Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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