Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb7P26011 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb7P26011 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms