Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RarbP22605 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RarbP22605 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RarbP22605 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RarbP22605 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RarbP22605 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RarbP22605 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RarbP22605 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RarbP22605 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RarbP22605 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RarbP22605 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms