Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnnc2P20801 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms