Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a2P20490 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ms4a2P20490 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms