Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RargP18911 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RargP18911 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RargP18911 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RargP18911 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RargP18911 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RargP18911 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RargP18911 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RargP18911 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RargP18911 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RargP18911 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RargP18911 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms