Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka1P18653 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rps6ka1P18653 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms