Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18533 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18533 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P18533 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18533 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms