Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P18532 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P18532 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P18532 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms