Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vpreb2P13373 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms