Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Nr4a1P12813 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms