Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa1P11477 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms