Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calm3P0DP28 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms