Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc8P09025 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc8P09025 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms