Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms