Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P01747 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01747 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01747 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms