Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vti1aO89116 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms