Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BlmO88700 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BlmO88700 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BlmO88700 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BlmO88700 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms