Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms