Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Lnx1O70263 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lnx1O70263 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms