Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms