Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CrxO54751 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CrxO54751 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
CrxO54751 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CrxO54751 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CrxO54751 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CrxO54751 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CrxO54751 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CrxO54751 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CrxO54751 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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