Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccrl2O35457 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms