Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptpn9O35239 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptpn9O35239 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptpn9O35239 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptpn9O35239 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptpn9O35239 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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