Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcns1O35173 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms