Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms