Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sec22bO08547 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms