Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3239L7N2D9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3239L7N2D9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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